Hidden Deep to klimatyczna gra eksploracyjna z mroczną fabułą sci-fi, której akcja dzieje się w ogromnym kompleksie 1.6km pod dnem oceanu. Grupa naukowców badała tam dziwne anomalie o nieznanym pochodzeniu. Wszystko wydawało się iść w dobrym kierunku kiedy nagle kontakt z bazą się urwał. 681 dni później zostaje zorganizowana kolejna wyprawa, którą musisz poprowadzić by zbadać co tam się stało.